所谓三级雨量警戒办法，就是根据降雨量的大小来决定对铁路区段是否实行出巡警戒、限速警戒、封锁警戒，以防止可能出现的洪灾。具体来说，就是当降雨量达到“出巡”警戒值时，铁路要派人冒雨出巡线路；当降雨量达到“限速”警戒值时，规定列车在区间限速每小时45公里运行；当降雨量达到“封锁”警戒值时，车站封锁区间，已进入区间的列车限速每小时25公里运行，铁路同时开行单机、轨道车或派人步行对线路设备进行全面检查。
为准确掌握降雨量，该局在铁路沿线上安设285台雨量计，作为全局监测雨量的重要“耳目”，担负着监测铁路沿线降雨量和降雨强度的重任，还在路局防洪办及全局所有工务段设专职雨量监测员，每天24小时实时监测管内降雨情况。6月8日至10日是今年以来最大的一次强降雨，南宁铁路局各雨量监测点监测到大雨119次、暴雨50次、大暴雨14次，由于推行三级雨量警戒办法，及时发现并防范了泥石流、边坡坍塌、水淹道床等水害14起，杜绝了因水害引发的行车事故。
多公里铁路线上的每一个区间，按照防洪能力强弱分为红色、橙色、绿色等级，有针对地制定了雨量警戒值，合理确定了警戒时间。最初，铁路区间内某个防洪地点的雨量达到封锁警戒值时，就封闭区间，直至警戒确认降级或解除后列车方能通过该区间，这种做法虽然保证了行车安全，但也牺牲了运输效率。为此，该局将区间限速调整为地段限速，并酌情提高了各区间的雨量警戒值，在满足特定条件的情况下，列车依然可以酌情慢速通过封锁区间。这种科学推行三级雨量警戒的办法，既有效地保证了安全，又满足了区域经济快速发展的运输需求。据了解，该局已连续三年实现了平安度汛，货物发送也连续三年突破1亿吨、成为全国货物发送增长最快的铁路局之一